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G蛋白质受体结构与功能数据的采集、挖掘与在线仓库的设计与实现开题报告

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1. 研究目的与意义

背景:

在人类基因组编码蛋白质的三万多个基因中,约30%编码的是膜蛋白质。膜蛋白质在生命过程中起着关键作用,参与了很多基础生命活动。它们作为载体帮助营养物质分子完成跨膜转运;作为受体帮助传导各种细胞信号;作为通道精细调控小分子与离子在细胞内外的浓度等等。因此,对膜蛋白质的结构与功能的研究直接关系到生命科学发展中的一些基础科学问题。与膜蛋白质的重要性及其在所有蛋白质中所占比重形成强烈反差的是,我们对于膜蛋白质的结构和功能的了解十分有限,这极大地限制了一些生命科学或者医学相关领域的发展。研究已经发现膜蛋白质与许多人类重要的疾病,如神经退行性疾病、心血管疾病、癌症等疾病的病理机制有直接关系。

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2. 研究内容与预期目标

研究内容:

g蛋白偶联受体参与众多生理过程。包括但不限于以下例子:

感光:视紫红质是一大类可以感光的g蛋白偶联受体。它们可以将电磁辐射信号转化成细胞内的化学信号,引导这一过程的反应称为光致异构化(photoisomerization)。具体细节为:由视蛋白(opsin)和辅因子视黄醛共价连接所构成的视紫红质在光源的刺激下,分子内的视黄醛会发生异构化,从“11-顺式”变成“全反式”,这个变化进一步引起视蛋白的构象变化从而激活与之偶联的g蛋白,引发下游的信号传递过程。

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3. 研究方法与步骤

研究方法:

1.生物物理技术

2.生物发光共振能量转移

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4. 参考文献

[1]Clinical significance of enzymatic lysophosphatidylcholine (LPC) assay data in patients with sepsis[J] . w.Cho,T. Park,Y.Park,J. Huh,C.-M. Lim,Y.Koh,D.-K.Song,S.-B.Hong. European Journal of Clinical Microbiology amp; Infectious Diseases . 2012(8)[2]AFM,ESEM,TEM, and CLSM in liposomal characterization: a comparative study[J] . Barbara RuoziFlavio Forni,Lucia Bondioli,Giovanni Tosi.Andrea Tombesi,Daniela Belletti,Maria Angela Vandelli. International Journalof Nanomedicine . 2011(defa)[3]Trifluoroethanol effects on helix propensity and electrostatic interactions in the helical peptide from ribonuclease T1[J] .Jeffrey K.Myers,C.Nick Pace,J.Martin Scholtz. Protein Science . 2008(2)[4]Structure of a Copper Pump Suggests a Regulatory Role for lts Metal-Binding Domain[』] . Chen-Chou Wu,Wwilliam J.Rice,David L.Stokes. Structure . 2008(6)[5]Multidrug efflux transporter, AcrB—-the pumping mechanism[J] . Satoshi Murakami. Current Opinion in Structural Biology . 2008(4)[6]Site - Specific Protein Modification on Living Cells Catalyzed by Sortase[J].TsutomuTanaka,TeruyasuYamamoto,ShinyaTsukiji, TeruyukiNagamune. ChemBioChem . 2008(5)[7]Tools for analyzing and predicting N - terminal protein modifications[J] . ThierryMeinnel,CarmelaGiglione.Proteomics . 2008 (4)[8]Mechanism of the Cell-Penetrating Peptide Transportan 10 Permeation of Lipid Bilayers[J] . Lindsay E.Yandek,Antje Pokorny,Anders Floren,Kristina Knoelke,lo Langel,Paulo F.F.Almeida. Biophysical Journal . 2007 (7)[9]The structure and function of heavy metal transport P1B -ATPases[J] .Jose M.Arguiello,Elif Eren,Manuel Gonzalez-Guerrero. BioMetals . 2007(3)[10]Atx1-like chaperones and their cognate P-type ATPases: copper-binding and transfer[J] . Chloe Singleton,Nick E.Brun. BioMetals . 2007(3)

5. 工作计划

(1)2022.2.21----2022.3.1查阅资料,撰写开题报告(2)2022.3.2----2022.3.15需求分析,熟悉开发工具(3)2022.3.16----2022.4.1概要设计 (4)2022.4.2----2022.4.15详细设计 (5)2022.4.16----2022.4.30编写代码及设计(6)2022.5.1----2022.5.10程序调试,毕业论文资料收集,撰写论文提纲(7)2022.5.11----2022.5.30整理设计文档,撰写毕业论文

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