簇毛麦基因组专化细胞学标记及4VS染色体特异的分子标记开发开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

一、意义研究概况及前景：随着小麦近缘物种的遗传物质不断导入普通小麦,对小麦中外源遗传物质鉴定的研究也在不断深入。

目前,鉴定方法有传统的形态学、细胞遗传学及生化标记与原位杂交、分子标记等，具体包括形态分析、染色体构型及分带、同工酶、种子储藏蛋白、rflp、rapd、aflp、ssr、scar和sts等。

前期研究表明小麦-簇毛麦4v(4d) 二体异代换系及t4dl4vs纯合易位系高抗小麦黄花叶病(wheat yellow mosaic virus，wymv)，并将抗黄花叶病基因(wss1) 定位于4v染色体短臂上。

2. 研究的基本内容和问题

一、研究目标通过设计大量引物来寻找特异性标记，以方便抗病材料的筛选。

二、研究内容4vs已测序，通过比较4vs与d组4d序列的差异，开发4vs特异分子标记。

三、拟解决的关键问题引物要具备特异性，并能够保持稳定。

3. 研究的方法与方案

一、研究方法primer3.0软件的引物设计、PCR技术进行DNA扩增、聚丙烯酰胺凝胶二、技术路线（1）4VS已测序，通过比较4VS与D组4D序列的差异，利用primer3.0进行引物设计。

（2）通过不同引物分别对4v、Hv、4VS的DNA模板进行扩增（3）通过聚丙烯酰胺凝胶观察特异性条带（4）反复进行以上步骤，确定大量分子标记三、可行性分析本实验室具有相关实验基础，并且也已获得相关材料，所以本实验室十分可行的。

4. 研究创新点

特色及创新之处：基于染色体分拣的簇毛麦一条染色体臂的测序及应用，鉴定的转座子是簇毛麦特异的。

5. 研究计划与进展

一、研究计划于2014年9月至2015年5月反复进行引物设计并通过跑胶确定特异性引物二、预期进展获得大量稳定的特异性分子标记