鸡Samd4基因剪切变异体的表达谱分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

sterilealphamotifdomaincontainingprotein4（samd4，也称为smaug1）最初发现于果蝇的胚胎，是一种rna结合蛋白，具有抑制mrna翻译的作用[1]。samd4基因是sam（sterilealphadomain）结构域家族中的一个基因,现已研究发现的sam结构域家族基因成员为samd1、samd4、samd5、samd7、samd9、samd11、samd12、samd14等。sam结构作为一类新的结构域,其很多特性还是未知的,该结构域具有生物物种进化上的高度保守性,除了能和sh2型蛋白的结合区域外,还作为一种与rna结合的蛋白存在于发育各个阶段和组织。sam结构域家族中的很多基因在表达调控、细胞分化、胚胎发育、分化、成熟等生命过程中发挥重要作用[2]。

目前国内外国外对samd4基因研究还较少，较多研究了sam结构域家族中的samd9基因。chen,z等发现samd4错义突变会导致小鼠营养不良、肌肉病变[1]；baezmv等发现samd4在神经元树突也有存在[3]。王群等发现samd9参与骨骼外钙质沉积，与多种疾病如动脉粥样硬化和自身免疫性疾病相关[4]；汤善宏等发现samd9基因在食管癌组织中表达水平与转移密切相关[5]。

基因的选择性剪接是一种重要的表达调节机制，其可使少量基因产生大量mrna和蛋白质的变异异构体，从而影响蛋白质的酶活性、细胞内定位、稳定性、翻译后的修饰以及链接绑定特性[6]。目前国内外对鸡samd4基因的剪切变异研究尚少，本实验旨在通过pcr扩增技术检测鸡samd4基因是否存在剪切变异，同时分析鸡samd4基因的组织表达差异，为进一步研究samd4基因在鸡发育、生长等方面所具有的功能奠定基础。

参考文献：

2. 研究的基本内容和问题

1.研究目标

1.1检测鸡samd4基因是否存在剪切变异

1.2了解samd4基因在鸡各组织中的表达差异

3. 研究的方法与方案

1.研究方法及方案

1.1总rna提取

用trizol法提取肉鸡组织样总rna,具体操作参照试剂盒说明书进行。提取的总rna用depc处理水溶解,琼脂糖凝胶电泳检测rna的完整性,-80℃保存备用。

4. 研究创新点

1.初步检测确定鸡Samd4基因是否存在剪切变异。

2.分析了鸡Samd4基因的组织表达差异。

5. 研究计划与进展

2015.9－2015.10：查阅相关的资料，设计实验；

2015.10－2015.12：总rna提取，引物设计合成；

2016.02-2016.04：，完成pcr扩增，检测是否有剪切变异，分析组织表达差异。