基于AI的蛋白质结构预测方法开题报告

 2023-06-27 08:06

1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)

一、蛋白质结构预测问题蛋白质是维持生命所必需的大而复杂的分子。

几乎渗透到我们身体的每一个功能收缩肌肉,感知光线,或将食物转化为能量,都可以追溯到一种或多种蛋白质,以及它们是如何运动和变化的。

蛋白质的结构决定其功能,例如,构成我们免疫系统的抗体蛋白是y形的,通过与病毒和细菌结合,抗体蛋白能够检测并标记致病微生物并进行消灭。

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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

本课题要研究的问题:以alphafold的模型和算法为基础,对蛋白质进行结构分类,预测几组特定结构或种类的蛋白质,对预测的结果进行评价,对alphafold已公布的模型和算法进行评价和总结,以此提出问题或不足并对以alphafold为代表的的深度学习方法预测蛋白质结构进行展望。

拟采用的研究手段:1)对pdb中的蛋白质结构进行分类。

2)采用alphafold模型和算法预测蛋白质的结构。

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